COVID-19 – DGML

Realizado: Dra. Tamara Frontanilla

DIAGNÓSTICO DEL COVID-19
  • La técnica de diagnóstico recomendada y aprobada actualmente por la OMS y CDC es la técnica por PCR (RT-qPCR). Esta es la que utiliza el laboratorio central de salud pública en Paraguay.
  • También existen otros métodos diagnósticos llamados “test rápidos” que detectan unos anticuerpos IgG e IgM y otras proteínas del virus.
  • La Agencia Federal de Drogas y Alimentos de Estados Unidos (FDA) aprobó recientemente un tipo de test molecular rápido que busca fragmentos del genoma del SARS-CoV-2. La metodología es similar a la de PCR. Utiliza un sistema isotermal real time RT LAMP. Por ahora, disponible únicamente en EEUU.
1. PCR o Reacción En Cadena De La Polimerasa para diagnóstico de COVID-19
  • En palabras simples, la PCR es una “fotocopiadora” molecular. Realiza millones de copias de una región de ADN para estudiarlo.
  • La técnica de PCR detecta la presencia del material genético del virus SARS-CoV-2 en los fluidos o secreciones del paciente como la saliva.
Ventajas de la PCR
  • Alta especificidad: puede diferenciar entre dos microorganismos muy cercanos evolutivamente.
  • Alta sensibilidad: puede detectar cantidades de 20 copias/ml, o incluso menos, de material genético viral.
  • Diagnóstico precoz: porque se detecta virus en las primeras fases de la infección respiratoria. Incluso en pacientes asintomáticos.
Desventaja
  • Mayor tiempo de procesamiento. Entrega de resultado en horas.
2. Test rápido de anticuerpos para diagnóstico de COVID-19
  • Detecta los anticuerpos IgG e IgM en el plasma que produce de la persona infectada contra el virus.
  • También puede detectar proteínas del virus que están presentes en las muestras respiratorias del paciente.
Ventaja del test rápido de anticuerpos
  • Menor tiempo: resultados en minutos.
Desventajas del test rápido de anticuerpos
  • No tienen capacidad diagnóstica durante fases tempranas de la infección.
  • También es posible un resultado positivo debido a la reacción cruzada con otras bacterias o virus, por lo que todavía se requiere una prueba confirmatoria basada en PCR.
PRUEBAS LABORATORIALES PARA DIAGNÓSTICO DEL COVID-19
Conceptos básicos
  • El primer paso para realizar el análisis es colectar la muestra del paciente. Se recomiendan principalmente hisopados nasofaríngeos.
  • La muestra que obtenemos del paciente tiene varios componentes, entre ellos, fluidos y células.
  • Para poder hacer en análisis por PCR para diagnosticar el COVID-19, es necesario extraer sólo el material genético (ADN y/o ARN) del núcleo de las células que se encuentran en esta muestra.
  • Esto se realiza por un proceso llamado “extracción de ADN /ARN”. Con este material genético extraído, pasamos a la siguiente fase donde se realiza el diagnóstico propiamente dicho, utilizando la técnica de PCR.
  • Los virus, como el SARS-CoV-2 causantes del COVID-19 no contienen ADN sino ARN.
  • Como las pruebas de PCR solo pueden hacer copias de ADN, primero hay que convertir el ARN en ADN utilizando la RT-PCR (del inglés Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction).
Variantes de la PCR para el diagnóstico del covid-19:
  1. La RT-PCR, del inglés Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction que se utiliza para amplificación o PCR de los virus que tienen ARN y no ADN. Este es un paso previo donde el ARN se convierte a ADN para seguir con la qPCR.
  2. La PCR en tiempo real o cuantitativa “qPCR”, del inglés Quantitative” cuantifica la cantidad de material genético del virus en la muestra del paciente. En esta reacción se añaden colorantes fluorescentes, que permiten confirmar la presencia del virus. La cantidad de fluorescencia determinará si la prueba es positiva o negativa.

Observación: La RT-PCR y qPCR son dos reacciones diferentes, pero deben de ser realizadas en conjunto para el diagnóstico del COVID-19 “RT-qPCR”